材料與方法
LX-100 手掌型離心機(jī)(江蘇海林市其林貝爾儀器制造有限公司);2-16PK 型高速臺(tái)式離心機(jī)(SIG- MA 公司);PCR 儀(TaKaRa);YP202N 電子天平(上 海精密科學(xué)儀器有限公司);DYY-6C 型電泳儀(北京 市六一儀器廠);微波爐(青島海爾制品有限公司)電 泳槽(北京君意東方電泳設(shè)備有限公司);Hws24 電熱 恒溫水浴鍋 (上海一恒儀器有限公司)Gel Doc 2 000 紫外凝膠成像分析系統(tǒng)(美國(guó) Bio-RAD)。Ex Taq DNA 聚合酶、Ex Taq Buffer、DNA Marker (2 000)、DNA 提取試劑盒 (TIANamp Genomic DNA Kit)、超凈水、引物、核酸電泳緩沖液(TAE)、6×Load- ing Buffer、瓊脂糖(AGAROSE G-10)、dNTP Mixture、 溴化乙錠(EB)。
結(jié)果
目前用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的基因,以線粒體 pcox1 和核糖體 ITS1、ITS2 基因應(yīng)用最為廣泛。其 中,在使用 pcox1 基因作為分子標(biāo)記時(shí)范圍沒(méi)有核糖 體 ITS1、ITS2 基因那么廣。pcox1 和 ITS 都擁有高度 的保守性,但 pcox1 基因的特點(diǎn)為種內(nèi)分化弱,種間 分化強(qiáng),而 rDNA 序列功能上具有進(jìn)化時(shí)鐘性,目前 已經(jīng)被應(yīng)用到物種分類與進(jìn)化分析中,尤其是種間 的分類。ITS 進(jìn)化快,物種內(nèi)發(fā)生變異的幾率小, 物種間發(fā)生變異的幾率大。通過(guò)分析 ITS 序列可以 構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)并分析其親緣關(guān)系。但是實(shí)驗(yàn)由于基因 庫(kù)中沒(méi)有片形褶皺絳蟲(chóng)的 pcox1 基因,所以用 pcox1 作為目的基因只鑒定了該未知蟲(chóng)體的屬,而無(wú)法確 定鑒定該絳蟲(chóng)具體是什么,而基因庫(kù)中有片形褶皺 絳蟲(chóng) ITS 的序列,所以我們可以確切的證明未知絳蟲(chóng) 為片形褶皺絳蟲(chóng)。
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